Новый подход для точного QSPR моделирования комплексообразования металлов: применение к константам устойчивости комплексов лантанидных ионов Ln3+, Ag+, Zn2+, Cd2+ и Hg2+ с органическими лигандами в воде

В. П. Соловьев,^a@ А. Ю. Цивадзе,^a А. А. Варнек^b

^aИнститут физической химии и электрохимии Российской академии наук, 119991 Москва, Россия
^bLaboratoire d’Infochimie, UMR 7177 CNRS, Université de Strasbourg, 67000 Страсбург, Франция

^@E-mail: solovev-vp@mail.ru

Макрогетероциклы 2012 5(4-5) 404-410

DOI: 10.6060/mhc2012.121104s

Предложено новое определение области применимости моделей, основанное на выборе достаточной порции индивидуальных QSPR моделей, чтобы быть принятыми для предсказания свойства. Подход продемонстрирован для оценки констант устойчивости logKML при использовании ансамбля моделей структура - свойство.

References

Click here to expand or collapse this section

1. Comprehensive Coordination Chemistry II. Applications of Coordination Chemistry. (Ward M. D., Ed.). San Diego: Elsevier, 2003.

2. Duca G. Homogeneous Catalysis with Metal Complexes. Fundamentals and Applications. Springer Series in Chemical Physics. Berlin, Heidelberg: Springer, 2012. Vol. 102.

3. Kumar S., Dhar D. N., Saxena P. N. J. Sci. Ind. Res., 2009, 68, 181-187.

4. Tretyakov Y. D., Martynenko L. I., Grigoryev A. N., Tsivadze A. Y. Inorganic Chemistry. Chemistry of Elements. Book 1. Moscow: Khimia, 2001.

5. Comprehensive Coordination Chemistry II. Bio-coordination Chemistry. (Que L. J., Tolman W. B., Eds.). San Diego: Elsevier, 2003.

6. Bhattacharya P. K. Metal Ions in Biochemistry. Harrow, U. K.: Alpha Science International, 2005.

7. Metal Ions in Biological Systems. Vol 37. Manganese and Its Role in Biological Processes. (Sigel A., Sigel H., Eds.). New York: CRC Press, 2000.

8. Drahoš B., Kotek J., Cı́sařová I., Hermann P., Helm L., Lukeš I., Tóth E. Inorg. Chem. 2011, 50, 12785-12801.

9. Svobodová I., Lubal P., Plutnar J., Havličková J., Kotek J., Hermann P., Lukeš I. Dalton Trans., 2006, 5184-5197.
http://dx.doi.org/10.1039/b603251f

10. Bazzicalupi C., Bencini A., Bianchi A., Borsari L., Danesi A., Giorgi C., Lodeiro C., Mariani P., Pina F., Santarelli S., Tamayo A., Valtancoli B. Dalton Trans., 2006, 4000-4010.
http://dx.doi.org/10.1039/b603505a

11. Hancock R. D. Analyst, 1997, 122, 51R–58R.
http://dx.doi.org/10.1039/a607993h

12. Hancock R. D., Martell A. E. Chem. Rev., 1989, 89, 1875-1914.
http://dx.doi.org/10.1021/cr00098a011

13. Martell A. E., Hancock R. D., Motekaitis R. J. Coord. Chem. Rev., 1994, 133, 39-65.
http://dx.doi.org/10.1016/0010-8545(94)80056-1

14. Dimmock P. W., Warwick P., Robbins R. A. Analyst, 1995, 120, 2159-2170.
http://dx.doi.org/10.1039/an9952002159

15. IUPAC Stability Constants Database. version 5.33, 2012. http://www.acadsoft.co.uk/ (accessed Sept. 20, 2012).

16. NIST Critically Selected Stability Constants of Metal Complexes Database. version 8.0, 2004. http://www.nist.gov/srd/nist46.cfm (accessed May 14, 2012).

17. Joint Expert Speciation System.A powerful research tool for modelling chemical speciation in complex environments. version Oct. 3, 2011, 1985 - 2012. http://jess.murdoch.edu.au/jess_home.htm (accessed Sept. 20, 2012).

18. Martell A.E., Smith R.M. Critical Stability Constants. New York: Plenum Press, 1989. Vol. 6.

19. Christensen J. J., Izatt R. M. Handbook of Metal Ligand Heats and Related Thermodynamic Quantities. New York: Marcel Dekker Inc., 1983.

20. Izatt R. M., Pawlak K., Bradshaw J. S., Bruening R. L. Chem. Rev., 1991, 91, 1721-2085.
http://dx.doi.org/10.1021/cr00008a003

21. Solov'ev V. P., Vnuk E. A., Strakhova N. N., Raevsky O. A. Thermodynamics of Complexation of the Macrocyclic Polyethers with Salts of Alkali and Alkaline-Earth Metals. Moscow: VINITI, 1991.

22. Varnek A., Solov'ev V. In: Ion Exchange and Solvent Extraction, A Series of Advances. (Sengupta A. K., Moyer B. A., Eds.). Boca Raton: CRC Press, Taylor and Francis Group, 2009, Vol. 19, p. 319-358.
http://dx.doi.org/10.1201/9781420059700-c5

23. Solov'ev V., Sukhno I., Buzko V., Polushin A., Marcou G., Tsivadze A., Varnek A. J. Incl. Phenom. Macrocycl. Chem., 2012, 72, 309-321.
http://dx.doi.org/10.1007/s10847-011-9978-6

24. Daraei H., Irandoust M., Ghasemi J. B., Kurdian A. R. J. Incl. Phenom. Macrocycl. Chem., 2012, 72, 423-435.
http://dx.doi.org/10.1007/s10847-011-0006-7

25. Li Y., Su L., Zhang X., Huang X., Zhai H. Chemom. Intell. Lab. Syst., 2011, 105, 106-113.
http://dx.doi.org/10.1016/j.chemolab.2010.11.005

26. Ghasemi J. B., Ahmadi S., Ayati M. Macroheterocycles, 2010, 3, 234-242.

27. Ghasemi J., Saaidpour S. J. Incl. Phenom. Macrocycl. Chem., 2008, 60, 339-351.
http://dx.doi.org/10.1007/s10847-007-9383-3

28. Solov'ev V. P., Varnek A. A. Rus. Chem. Bull., 2004, 53, 1434-1445.
http://dx.doi.org/10.1023/B:RUCB.0000046239.65581.99

29. Varnek A. A., Wipff G., Solov'ev V. P., Solotnov A. F. J. Chem. Inf. Comput. Sci., 2002, 42, 812-829.
http://dx.doi.org/10.1021/ci010318q

30. Solov'ev V. P., Varnek A. A., Wipff G. J. Chem. Inf. Comput. Sci., 2000, 40, 847-858.
http://dx.doi.org/10.1021/ci9901340

31. Gakh A. A., Sumpter B. G., Noid D. W., Sachleben R. A., Moyer B. A. J. Incl. Phenom. Mol. Recognit. Chem., 1997, 27, 201-213.
http://dx.doi.org/10.1023/A:1007928814162

32. Shi Z. G., McCullough E. A. J. Incl. Phenom. Mol. Recognit. Chem., 1994, 18, 9-26.
http://dx.doi.org/10.1007/BF00706935

33. Solov'ev V. P., Kireeva N., Tsivadze A. Y., Varnek A. J. Incl. Phenom. Macrocycl. Chem., 2012, Published online 13 June 2012

34. Cabaniss S. E. Environ. Sci. Technol., 2008, 42, 5210–5216.
http://dx.doi.org/10.1021/es7022219

35. Solov'ev V. P., Kireeva N. V., Tsivadze A. Y., Varnek A. A. J. Struct. Chem., 2006, 47, 298-311.
http://dx.doi.org/10.1007/s10947-006-0300-1

36. Toropov A. A., Toropova A. P., Nesterova A. I., Nabiev O. M. Russ. J. Coord. Chem., 2004, 30, 611–617.
http://dx.doi.org/10.1023/B:RUCO.0000040719.08826.15

37. Toropov A. A., Toropova A. P. Russ. J. Coord. Chem., 2002, 28, 877-880.
http://dx.doi.org/10.1023/A:1021694514880

38. Raevskii O. A., Sapegin A. M., Chistyakov V. V., Solov'ev V. P., Zefirov N. S. Koord. Khim., 1990, 16, 1175-1184.

39. Varnek A., Fourches D., Kireeva N., Klimchuk O., Marcou G., Tsivadze A., Solov'ev V. Radiochim. Acta, 2008, 96, 505-511.
http://dx.doi.org/10.1524/ract.2008.1518

40. Tetko I. V., Solov'ev V. P., Antonov A. V., Yao X. J., Fan B. T., Hoonakker F., Fourches D., Lachiche N., Varnek A. J. Chem. Inf. Model., 2006, 46, 808-819.
http://dx.doi.org/10.1021/ci0504216

41. Svetlitski R., Lomaka A., Karelson M. Separat. Sci. Technol., 2006, 41, 197-216.
http://dx.doi.org/10.1080/01496390500446194

42. Qi Y.-H., Zhang Q.-Y., Xu L. J. Chem. Inf. Comput. Sci., 2002, 42, 1471-1475.
http://dx.doi.org/10.1021/ci020027x

43. Solov'ev V., Marcou G., Tsivadze A. Y., Varnek A. Ind. Eng. Chem. Res., 2012, 51, 13482-13489.
http://dx.doi.org/10.1021/ie301271s

44. Raos N., Miličević A. Arch. Ind. Hyg. Toxicol., 2009, 60, 123-128.
http://dx.doi.org/10.2478/10004-1254-60-2009-1923

45. Grgas B., Nikolić S., Paulić N., Raos N. Croat. Chem. Acta, 1999, 72, 885-895.

47. Baskin I., Varnek A. In: Chemoinformatics Approaches to Virtual Screening. (Varnek A., Tropsha A., Eds.). Cambridge: RSC Publishing, 2008, p. 1-43.
http://dx.doi.org/10.1039/9781847558879-00001

48. Katritzky A. R., Fara D. C., Yang H., Karelson M., Suzuki T., Solov'ev V. P., Varnek A. J. Chem. Inf. Comp. Sci., 2004, 44, 529-541.
http://dx.doi.org/10.1021/ci034190j

49. Varnek A., Fourches D., Sieffert N., Solov'ev V. P., Hill C., Lecomte M. J. Solv. Extr. Ion. Exch., 2007, 25, 1-26.
http://dx.doi.org/10.1080/07366290601067481

50. Varnek A., Fourches D., Solov'ev V., Klimchuk O., Ouadi A., Billard I. Solv. Extr. Ion Exch., 2007, 25, 433-462.
http://dx.doi.org/10.1080/07366290701415820

51. Horvath D., Bonachera F., Solov'ev V., Gaudin C., Varnek A. J. Chem. Inf. Model., 2007, 47, 927-939.
http://dx.doi.org/10.1021/ci600476r
PMid:17480052

52. Kireeva N. Modèles QSPR multiples pour les constants de stabilité de complexes métaux – ligands organiques en solution et de points de fusion de liquides ioniques. Thesis. Strasbourg: Université de Strasbourg, 2009.

53. ISIDA (In Silico Design and Data Analysis) program. version 5.76, 2008 - 2012. http://infochim.u-strasbg.fr/spip.php?rubrique53 or http://vpsolovev.ru/programs/ (accessed Nov. 09, 2012).

54. Varnek A., Fourches D., Hoonakker F., Solov'ev V. P. J. Comput. Aid. Mol. Des., 2005, 19, 693-703.
http://dx.doi.org/10.1007/s10822-005-9008-0

55. Arnaud-Neu F., Delgado R., Chaves S. Pure Appl. Chem., 2003, 75, 71-102.
http://dx.doi.org/10.1351/pac200375010071

56. Batyaev I., Fogileva R. Zh. Neorg. Khim., 1974, 19, 670-673.

57. Sekhon B. S., Chopra S. L. Thermochim. Acta, 1973, 7, 151-157.
http://dx.doi.org/10.1016/0040-6031(73)87017-0

58. Bianchi A., Calabi L., Ferrini L., Losi P., Uggeri F., Valtancoli B. Inorg. Chim. Acta, 1996, 249, 13-15.
http://dx.doi.org/10.1016/0020-1693(96)05182-1

59. Aime S., Anelli P. L., Botta M., Fedeli F., Grandi M., Paoli P., Uggeri F. Inorg. Chem., 1992, 31, 2422-2428.
http://dx.doi.org/10.1021/ic00038a023

60. Choppin G. R., Liu Q., Rizkalla E. N. Inorg. Chim. Acta, 1988, 145, 309-314.
http://dx.doi.org/10.1016/S0020-1693(00)83975-4

61. Makushova G. N., Ternovaya T. V., Kostromina N. A. Koord. Khim., 1981, 7, 372-376.

62. Narayana V. G., Swamy S. J., Lingaiah P. Indian J. Chem., 1986, 25A, 491-493.

63. Pakhomova D. V., Kumok V. N., Serebrennikov V. V. Zh. Neorg. Khim., 1969, 14, 1434-1435.

64. Sandhu R. S., Gandhi J. S., Kumar R. Thermochim. Acta, 1981, 47, 117-119.
http://dx.doi.org/10.1016/0040-6031(81)85015-0

65. Feige P., Mocker D., Dreyer R., Münze R. J. Inorg. Nucl. Chem., 1973, 35, 3269-3275.
http://dx.doi.org/10.1016/0022-1902(73)80029-6

66. Martynenko L. I., Muratova N. M., Borisova A. P. Zh. Neorg. Khim., 1980, 25, 713-716.

67. Babich V. A., Gorelov I. P. Zh. Anal. Khim., 1971, 26, 1832.

68. Wang Z.-M., van de Burgt L. J., Choppin G. R. Inorg. Chim. Acta, 1999, 293, 167-177.
http://dx.doi.org/10.1016/S0020-1693(99)00234-0

69. Choppin G. R., Rizkalla E. N., El-ansi T. A., Dadgar A. J. Coord. Chem., 1994, 31, 297-304.
http://dx.doi.org/10.1080/00958979408024223

70. Degischer G., Choppin G. R. J. Inorg. Nucl. Chem., 1972, 34, 2823-2830.
http://dx.doi.org/10.1016/0022-1902(72)80588-8

71. Powell J. E., Farrell J. L., Neillie W. F. S., Russell R. J. Inorg. Nucl. Chem., 1968, 30, 2223-2231.
http://dx.doi.org/10.1016/0022-1902(68)80221-0

72. Solov'ev V., Oprisiu I., Marcou G., Varnek A. Ind. Eng. Chem. Res., 2011, 50, 14162-14167.
http://dx.doi.org/10.1021/ie2018614

73. Varnek A., Solov'ev V. P. Comb. Chem. High Throughput Screening, 2005, 8, 403-416.
http://dx.doi.org/10.2174/1386207054546513

74. Varnek A., Kireeva N., Tetko I. V., Baskin I. I., Solov'ev V. P. J. Chem. Inf. Model., 2007, 47, 1111-1122.
http://dx.doi.org/10.1021/ci600493x

75. Muller P. H., Neumann P., Storm R. Tafeln der mathematischen Statistik. Leipzig: VEB Fachbuchverlag, 1979.

Прикрепленный файл	Размер
mhc2012_t05n4-5_404-410.pdf	1.4 Мб

Журнал "Макрогетероциклы"

Навигация

Languages

Новости

Поиск

В. П. Соловьев,^a@ А. Ю. Цивадзе,^a А. А. Варнек^b

References

Журнал "Макрогетероциклы"

Навигация

Languages

Новости

Поиск

В. П. Соловьев,a@ А. Ю. Цивадзе,a А. А. Варнекb

References

В. П. Соловьев,^a@ А. Ю. Цивадзе,^a А. А. Варнек^b